Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb1P28230 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.1 ms