Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Opn1mwO35599 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms