Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rrn3B2RS91 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms