Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Brpf1B2RRD7 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Brpf1B2RRD7 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms