Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CtcflA2APF3 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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