Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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