Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NsmfQ99NF2 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms