Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms