Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx2P81066 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx2P81066 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms