Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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