Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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