Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Usp4P35123 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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