Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms