Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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