Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms