Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms