Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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PtprbB2RU80 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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PtprbB2RU80 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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PtprbB2RU80 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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