Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rb1cc1Q9ESK9 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rb1cc1Q9ESK9 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rb1cc1Q9ESK9 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rb1cc1Q9ESK9 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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