Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Smurf1Q9CUN6 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms