Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Snw1Q9CSN1 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms