Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hps4Q99KG7 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms