Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc71Q8VEG0 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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