Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CipcQ8R0W1 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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