Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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