Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NipblQ6KCD5 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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