Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
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