Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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