Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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