Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms