Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms