Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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