Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms