Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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