Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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