Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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