Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BC024978J3QPC3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms