Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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