Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usf3B2RUQ2 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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Usf3B2RUQ2 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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Usf3B2RUQ2 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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Usf3B2RUQ2 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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Usf3B2RUQ2 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Usf3B2RUQ2 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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