Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms