Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Atg3Q9CPX6 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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