Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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