Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GcsamQ6RFH4 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms