Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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