Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms