Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms