Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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