Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms