Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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