Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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