Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnn1Q08091 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms